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现有疫苗全部无效!尼日利亚变种病毒成迄今最恐怖突变?

黄琨

尼日利亚病毒

科学界一直担心,新冠病毒变异得如此之快,会不会在某个时候出现使疫苗失效的毒株。如今,这个噩梦成真了。

意大利病毒学学会主席、微生物实验室主任阿纳尔多·卡鲁索表示,在意大利北部伦巴第区布雷西亚出现了尼日利亚发现的变异新冠病毒毒株。卡鲁索称,这种新型病毒变异性强,目前现有疫苗对该病毒无效。

虽然意大利方面未公布具体信息,也尚没有详细的研究报告出炉,但微博上多位长期关注病毒的科普博主表示了对这一情况的重视。

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评论区有自称身在德国的网友透露,当地养老院出现了老人接种疫苗后全部感染的情况。

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12月中旬,尼日利亚首先在新冠患者的病毒基因组序列中检测到B.1.525毒株,之后,英国、法国等地也很快发现了该变种。仅仅2个月后,B.1.525就占到尼日利亚感染病例20%以上,全球有200多个病例中发现了这种病毒。

据福布斯新闻,病毒的主要变异是,S蛋白N端结构域的Q52R和A67出现了氨基酸替代,以及69-70和144位点的缺失。前者是新变种所特有的,后面2个位点的缺失则同样出现在了此前的英国变种B.1.1.7上。

由于新冠病毒的N端结构域具有很高的抗原性,这个区域发生突变,很容易导致抗体中和逃逸现象出现。

此外,1例抗体中和逃逸变体中还出现了S蛋白膜近端干区的888位和870位氨基酸替换。

B.1.525携带了多种常见的新冠病毒突变,比如D614G,这个极大增强病毒传染性的突变几乎存在现阶段所有病毒变种中;还有之前南非变种出现E484K突变,使人对几种疫苗产生大约3倍的耐药性,对大多数恢复期抗体产生10倍的耐药性。

Q677H位置的氨基酸替换,在美国最近发现的变种病毒中也有出现。这种突变发生在S蛋白远离受体结合域的S1部分,与D614G突变一样,可能增加S1-S2关联的稳定性,从而增强传播能力。该突变也可能有利于受体结合域的开放而不是封闭结合。

B.1.525在构成其他蛋白质的基因组区域中也出现了大量突变,其中3个发生在构成大规模复制复合物的基因中,包括Orf1a NSP3:(T1189I),NSP6:(3个氨基酸106-108缺失),1个在主要的RNA依赖性RNA聚合酶Orf1b NSP12:(P323F)。

病毒结构蛋白E:(l21F)、M:(i82f)和N:(A12G)和(T208I)的基因也出现了4个突变。这些突变大量出现的跨膜蛋白NSP6、E、M 、N蛋白,在新冠患者中具有高度的抗原性。所有这些突变都可能导致抗体中和逃逸。

orf1a中的其余突变可能提高复制效率,或者导致抗体中和逃逸,亦或是同时导致2种后果。

编译/前瞻经济学人APP资讯组

参考资料:

【1】https://www.forbes.com/sites/williamhaseltine/2021/02/24/new-nigerian-variant-continues-the-trend-of-dangerous-strains-threatening-covid-19-progress/

【2】https://theconversation.com/new-coronavirus-variant-here-is-what-scientists-know-about-b1525-155388


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