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推进新冠药物筛选研发!西安交大一附院抗疫课题“神农计划”研究成果登JCIM封面

Evelyn Zhang

新冠病毒的出现,在全球范围内影响了人类健康,而病毒与宿主之间的相互作用,是这一疾病发生的基础。

病毒基因组为一组蛋白质编码,每一组蛋白质在宿主入侵或病毒发育时都有独特的功能。在当前的不利情况下,西安交大一附院的研究人员们利用虚拟筛选工具,寻找已经存在于药物库(DrugBank)中的药物和天然产物,希望加快新冠药物发现的进程。

蛋白

近期,西安交大一附院参与的一项研究,基于病毒蛋白和人类ACE2受体的结构,使用自主的系统进行药物筛选,对各种报告中的候选药物进行了初步评估。

此外,他们还建立了一个交互式的在线平台(https://shennongproject.ai/)来浏览这些结果,将一个小分子的视觉显示与它潜在的目标蛋白对接,而不需要安装任何专门的结构软件。

这是迄今为止全球最大的、完全免费公开的新冠药物虚拟筛选数据库。随着实验室工作数据的持续维护和整合,它不仅可以作为新药发现的评估工具,也可以作为公众的教育科普网站。

上述研究成果,体现了西安交大一附院参与的抗疫课题“神农计划”取得的最新进展。“神农计划”由西安交通大学第一附属医院与华为智能医疗部门、中国科学院北京基因组研究所、华中科技大学同济医学院联合发起。

该项目对新冠病毒在入侵过程中全部蛋白的协同作用做了详细的阐述,根据新冠病毒在人体复制过程中18个关键蛋白以及人的ACE2受体的三维结构,选择出了30个药物潜在作用位点。

近日,“神农计划”第一期前期成果以“Systemic in silico screening in drug discovery for Coronavirus Disease (COVID-19) with an online interactive web server”为题,发表在美国化学学会期刊《化学信息与建模杂志》(Journal of Chemical Information and Modeling)上,以封面形式刊出,在国际上受到了广泛关注。西安交通大学为第一通讯单位,刘冰教授是该论文的通讯作者之一。

编译/前瞻经济学人APP资讯组

论文链接:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.0c00821?__cf_chl_captcha_tk__=1a002ce455aff82d8c2935dba5cbf57294f6d888-1615425772-0-ATbjR4B1xqpSJM3_BYW6BLkPPB94jHegCqBkrrXTNnUKac4cG7aIgX4VXt2Rw14no9KtbvNtouO2M2rG15Sl0kLMFJcnOeQtSzDXxduSplrcXctZ0gxt7PhUU8V6eFJ0VhkZQHQpUnQu3-1DYnwIBD4E-J0-DPIGu8J0fzb9ef9DV_OZmdVk2MmpgY9esoHJLkWlAoLuzfI1n7TJGRWPW6O3av328HRSGtYbReTt_-gTOMoqaGlsJ8e8iQahIJJhqkNLJSLFsH6SbNUxbw797o3nvKmAgRcyXskUgePDNuhMSzEj7CEH7qlq7g31HscJFRdddQ6V9slPMwOGDKtvHSHxRV992ukHtrt0EhwsWf9yOgE9GP-4W1h-NDLnVN8s-Z2vl47MH7ANBtcTkGC4u_zvyJXJHJZyx88adkQOia7AjhFBRttuneb0GIeg9eAwDlmGaMk3O-wdVQdZ6F97h7GugOXOuNmw7m1XbImOrfeaM-Qc7r-CYlHB79rcztA3sEElcBuEVQQ-iPQd-LjujcGfasQHYCE--ABadxnDYvPXfJGbzpBjGV8wTgK6CMeBDrdKXZe5CZ6_iCcuIk8U5Syz59zeX3angMo_Et0PFBqPgCdAuiSRGfDkknsgwjeqfg


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