人工栽培草莓（F. ananassa）是一种重要的水果作物，其果实深受世界各国人民的喜爱。
该物种是一种异源多倍体(Fragaria×ananassa，8n=56)，基因组复杂，杂合度高。其基因组最近被测序，为栽培草莓和蔷薇科近缘种提供了关键的参考基因组。
近日，湖北省农科院以“Reannotation of the cultivated strawberry genome and establishment of a strawberry genome database”为题，在《园艺研究》（Horticulture Research）上发表了他们的最新研究成果。
目前对人工栽培草莓基因组的注释，主要依赖于从头预测，在较小程度上依赖于转录组数据。
在他们的研究中，湖北农科院的研究人员们基于一个PacBio全长RNA文库和92个Illumina RNA测序文库，基于这两大技术，对F. ananassa基因组进行了结构和功能重新注释。他们对栽培草莓的基因组进行重注释，显著地提升了栽培草莓基因组注释的完整度和准确度，获得栽培草莓基因组注释新版本v1.0.a2。
这一改进的人工栽培草莓（F. ananassa）基因组注释共包含108447个基因模型，其中BUSCOs完整度为97.85%。19174个基因的模型被修改，360个新基因被鉴定，11044个基因被发现具有交替剪接的亚型。
此外，研究人员们构建了一个草莓基因组数据库(SGD)，用于草莓基因同源性的搜索和注释下载。
最后，他们对4个发育阶段的人工栽培草莓（F. ananassa）花贮和瘦果的转录组进行了重新分析和鉴定，并给出了该注释中所有基因的表达谱。
该研究为蔷薇科草莓的基因组分析和基因功能研究提供了基础。
编译/前瞻经济学人APP资讯组
论文链接：https://www.nature.com/articles/s41438-021-00476-4
疯狂爆灯！哈哈哈~~~~
，，各个行业都有？我每天下几篇，重点是不用钱！！适合学生党！！。给传报告的加鸡腿好嘛~~~
1万一小时定律，我一定要明年薪水翻倍！
