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前瞻基因产业全球周报2022第2期:癌症中最常见的基因突变排行榜公布,50万人“中华基因组计划-姑苏”项目启动

Paris Li

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重磅!癌症中最常见的基因突变排行榜公布

2022年1月4日获悉,美国弗吉尼亚大学和索尔克研究所的研究人员在《Nature Commnications》期刊发表了题为:“Cancer gene mutation frequencies for the U.S. population”的研究论文。研究团队将基因突变信息与癌症患病率数据相结合,揭示了整个美国癌症患者人群中癌症的遗传基础。这项工作揭示了每个基因在癌症患者群体中发生突变的频率,这些发现可以帮助指导开发更有效的癌症治疗方法。研究团队统计发现,癌症中最常见的基因突变是TP53(34.5%),其次是PIK3CA(13.5%),LRP1B(13.1%),令人意外的是,只有11%的癌症发生了KRAS基因突变,这远低于之前认为的25%。排在前十位的还有APC、FAT4、KMT2D、KMT2C、BRAF。

“中华基因组计划-姑苏”启动,将对50万人开展全基因组测序

2022年1月8日,南京医科大学第八次科技工作大会在江宁校区召开。胡志斌校长介绍,“中华基因组计划—姑苏(CGP-Gusu)”项目将与苏州市政府合作,以江苏多个成熟队列研究的50万志愿者生物样本为依托,基于生活、疾病信息等健康大数据信息,通过全基因组测序及后续其他组学计划,建成大型中国汉族人群生物资源共享平台和健康数据共享平台。

产业动态

华大基因子公司肠癌检测产品获沙特阿拉伯食品药品管理局批准上市

2022年1月7日,华大基因午间公告称,全资子公司BGI Europe A/S的肠癌辅助诊断产品于近日获得沙特阿拉伯食品药品管理局(Saudi Food & Drug Authority)批准上市。该产品适用于体外定性检测人粪便样本中SDC2、ADHFE1、PPP2R5C基因的甲基化情况。

生物技术公司Illumina与SomaLogic宣布建立共同开发伙伴关系

2022年1月5日,生物技术公司Illumina, Inc.宣布已经与SomaLogic达成了一项最终的共同开发协议,将SomaScan®蛋白质组学测定引入Illumina目前和未来的高通量新一代测序(NGS)平台。这一合作关系加速了蛋白质组学市场中快速增长的高通量领域。凭借Illumina NGS技术的规模和速度,研究人员可以更有效、更高效地建立从基因序列到细胞功能的生物联系,并加速实现临床影响的机会。 

免疫肿瘤学公司2seventy bio宣布与诺和诺德签订扩大合作协议

2022年1月3日,免疫肿瘤学公司2seventy bio, Inc.宣布已经与诺和诺德签订了一项选择权和许可协议,共同研究和开发体内基因编辑治疗A型血友病的方法,该协议建立在两家公司之间现有的成功的多年研究合作基础上。根据该协议条款,诺和诺德公司将有权选择授权2seventy bio公司基于mRNA的megaTAL™专利技术,为A型血友病患者开发一种新的治疗方法,目的是提供持续的治疗效果。 

基因编辑公司Intellia Therapeutics与Kyverna Therapeutics达成合作

2022年1月5日,临床阶段基因编辑公司Intellia Therapeutics, Inc.与制药公司Kyverna Therapeutics宣布了一项许可和合作协议,开发异体CD19嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法,治疗各种B细胞介导的自身免疫性疾病。作为协议的一部分,Intellia授予Kyverna使用其专有基于CRISPR/Cas9异体平台开发KYV-201的权利,这是一种用于治疗特定自身免疫性疾病的新一代CD19 CAR T细胞候选研究项目。作为交换,Intellia获得了Kyverna的股权,并对Kyverna进行了追加投资。Kyverna将领导和资助KYV-201的临床前和临床开发。

诺华Zolgensma在中国获得临床试验默示许可

2022年1月9日获悉,中国国家药监局药品审评中心(CDE)信息公开中心显示,诺华(Novartis)旗下治疗脊髓性肌萎缩(Spinal Muscular Atrophy,SMA)的AAV基因治疗药物Zolgensma(OAV101注射液)在中国递交的临床试验申请已获得临床试验默示许可。

Genprex基因疗法获FDA快速通道资格

2022年1月5日,基因治疗公司Genprex宣布,美国FDA已授予基因疗法Reqorsa快速通道资格(FTD),与默沙东(MSD)的重磅PD-1抑制剂Keytruda(帕博利珠单抗,pembrolizumab)联用,治疗经组织学证实无法切除的III期或IV期非小细胞肺癌(NSCLC)患者。这些患者在接受Keytruda单药治疗后发生疾病进展。在2022年第一季度,Genprex预计将启动一项开放标签、多中心的1/2期临床试验,以评估这一治疗组合在此患者群体中的疗效与安全性。

艾德生物PCR-11基因被纳入日本医保

2022年1月7日,艾德生物发布公告称,基于PCR技术平台自主研发的肺癌多基因联合检测产品“AmoyDx® Pan lung cancer PCR panel”(即PCR-11基因)于近日被纳入日本医保,用于检测多个肺癌核心驱动基因。该产品囊括了EGFR、ALK、ROS1、BRAF、RET、MET、HER2、KRAS、NTRK1、NTRK2、NTRK3共11个肺癌核心驱动基因,涵盖了《非小细胞肺癌分子病理检测临床实践指南(2021版)》中推荐肺癌一线检测必检基因及罕见突变基因,是礼来、安进、默克等药企肿瘤药物临床试验的伴随诊断。

轻松集团与癌症精准医疗公司泛生子达成战略合作

2022年1月7日获悉,轻松集团与全球前沿的癌症精准医疗公司泛生子达成战略合作。这是轻松集团在肝病管理服务领域的又一次重要布局,泛生子专注癌症基因组学的研究和应用,双方将携手提供癌症早期筛查、用药指导、预后监测、肿瘤新药研发服务等覆盖癌症全周期的产品与服务。同时,轻松集团将积极推动区块链、大数据、人工智能、5G、云计算等新兴技术在业务场景的落地应用。

基蛋生物拟斥3000万开展分子诊断与基因检测业务

2022年1月3日获悉,基蛋生物公告,公司拟使用自有资金3000万元投资设立全资子公司江苏新序生物科技有限公司。该子公司将开展分子诊断与基因检测相关仪器、试剂、耗材的研发、生产和销售业务。公司本次设立子公司,将业务扩展到分子与基因检测板块,将有助于进一步完善公司业务布局。

红日药业KB项目获得美国FDA快速通道资格

2022年1月4日,红日药业公告,在研产品注射用甲磺酸苦柯胺B项目获得美国FDA快速通道资格,用于治疗脓毒症。KB是目前全球唯一的一种双靶标细菌病原体相关分子拮抗剂,是以LPS和CpG DNA为双靶标研发的治疗脓毒症药物。

生物技术公司REGENXBIO宣布FDA批准RGX-202的临床试验申请

2022年1月6日,生物技术公司REGENXBIO Inc.宣布,美国食品药品监督管理局(FDA)批准了其新药研究(IND)申请,以评估基因疗法RGX-202用于在首次人体临床试验中治疗杜氏肌营养不良症(Duchenne)。RGX-202旨在传递一种新型微营养素的转基因,其中包括自然发生的肌营养素中的C-末端(CT)结构域的功能元素。RGX-202使用REGENXBIO专有的NAV® AAV8载体。公司计划在2022年上半年启动该试验。

基因治疗公司Genprex宣布扩大肿瘤学研究和开发管道

2022年1月4日,专注于为癌症和糖尿病患者开发改变生活疗法的临床阶段基因治疗公司Genprex, Inc.宣布已经扩大了其肿瘤学研究和开发管道,将小细胞肺癌(SCLC)作为其主要候选药物REQORSA™免疫基因疗法的一个额外疾病适应症。小细胞肺癌约占肺癌市场的10-15%,而REQORSA的最初目标适应症非小细胞肺癌(NSCLC)约占肺癌市场的84%。Genprex的肿瘤项目利用其独特的、专有的、非病毒的ONCOPREX®纳米颗粒递送系统,公司认为这是第一个用于人类癌症的系统性基因疗法递送平台。

首付款5000万美元!礼来与Entos Pharmaceuticals达成合作

1月6日,礼来与Entos Pharmaceuticals达成了一项研究和合作协议,合作将利用Entos的Fusogenix脂蛋白载体(proteolipid vehicle, PLV)核酸递送技术递送礼来提供的治疗药物到中枢和外周神经系统的靶细胞中。Entos将负责生成、开发和优化PLV,礼来将负责选择用于临床开发和商业化的PLV。根据协议条款,Entos将获得5000万美元的首付款,其中包括礼来对Entos的股权投资。对于合作中的每个项目,Entos还有资格获得高达4亿美元的潜在开发和商业里程金,以及产品成功开发和商业化的版税。

圣湘生物核酸检测分析仪获得FDA批准注册

2022年1月5日获悉,圣湘生物1月4日晚间公告,公司的产品核酸检测分析仪于近日获得美国FDA批准注册。截至目前,公司该产品已获得FDA的批准注册,受境外疫情发展及控制情况、中美关系、境外市场推广、客户认可等多种因素影响,产品销售及利润贡献具有不确定性,尚无法预测上述产品获得FDA批准注册对公司未来经营业绩的具体影响。

分子诊断公司DiaCarta宣布与美国国家癌症研究所签订合作研究与开发协议

2022年1月5日,精准分子诊断公司DiaCarta Inc.宣布根据与美国国家卫生研究院下属的国家癌症研究所(NCI)签订的合作研究与开发协议(CRADA),该公司将合作评估和开发DiaCarta专有的异种核酸(XNA)分子技术。NCI和DiaCarta将在以下项目中进行合作:①利用DiaCarta专有的异种核酸(XNA)分子技术调查癌症和罕见疾病的低频突变事件;②开发用于原位癌细胞检测的XNA探针。

体外诊断公司Pillar Biosciences宣布NGS实验室获得CLIA认证

2022年1月6日,体外诊断公司Pillar Biosciences宣布NGS实验室已经通过了现场检查,并获得了美国卫生与公众服务部医疗保险和医疗补助服务中心(CMS)以及马萨诸塞州政府的许可,获得了临床实验室改进修正案(CLIA)的认证。该认证使实验室能够支持临床前研究和临床试验,并具有为Pillar Biosciences的制药合作伙伴提供配套诊断的长期潜力。

基因研究

新突破!研究人员成功利用CRISPR-Cas9靶向脂肪细胞

2022年1月5日获悉,在一项新的研究中,美国密歇根大学医学院分子与综合生理学系研究人员描述了使用CRISPR-Cas9取得的新突破。相关研究结果发表在《Journal of Biological Chemistry》期刊上,论文标题为“BAd-CRISPR: Inducible gene knockout in interscapular brown adipose tissue of adult mice”。CRISPR-Cas9是一种基因编辑技术,由一种切割DNA链的叫做Cas9的酶和一种引导Cas9到基因组中的特定位置进行编辑的向导RNA(gRNA)组成。这种工具被包装到一种无害的病毒载体中,以便将它运送到被研究的细胞。通过使用该技术,研究人员能够成功地靶向棕色脂肪,这是一种用于产生热量和保护核心体温的特殊脂肪组织。 

中国科学家首次揭示:肢体发育相关基因影响指纹形成

2022年1月7日,中科院上海营养与健康研究所汪思佳研究员团队、爱丁堡大学Denis Headon教授团队和复旦大学金力院士团队联合国内外十余家科研机构,在Cell上发表了以《肢体发育基因构成人类指纹花纹差异的基础》为题的研究成果,他们分析了几百万遗传位点和指纹花纹之间的关系,认为肢体发育相关基因在指纹的形成中发挥了关键作用。

科学家首次实现对血管内皮细胞进行基因组编辑

近日,一篇发表在国际杂志《Cell Reports》上题为“Robust genome editing in adult vascular endothelium by nanoparticle delivery of CRISPR-Cas9 plasmid DNA”的研究报告中,来自美国西北大学Feinberg医学院等机构的科学家们通过研究开发了一种特殊的纳米颗粒,其能将包括CRISPR/Cas9在内的基因编辑技术运输到内皮细胞中,内皮细胞是一种位于血管壁的细胞;这是研究人员首次实现对血管内皮细胞进行基因组编辑,因为通常通过病毒运输CRISPR/Cas9的方法对这类细胞并不会起作用。

港科大研究显示:人体T细胞免疫反应可有效应对奥密克戎

2022年1月3日获悉,香港科技大学表示,该校与澳大利亚墨尔本大学共同进行的一项研究显示,新冠病毒奥密克戎变异毒株难以通过突变逃脱人体T细胞免疫反应的攻击。据研究人员介绍,尽管奥密克戎较其他变异株包含更多基因突变,但人类赖以防御病毒的T细胞免疫反应,仍能应对奥密克戎带来的挑战。

科学家研究发现基因突变或能预测化疗所带来的心脏毒性效应

近日,一篇发表在国际杂志《Circulation》上题为“Identification of Drug Transporter Genomic Variants and Inhibitors that Protect Against Doxorubicin-Induced Cardiotoxicity”的研究报告中,来自美国西北大学Feinberg医学院等机构的科学家们通过研究展示了人类诱导多能干细胞模型的力量,其能将SNP从统计学关联转化为药物发现,从而就为临床试验提供了人类细胞测试数据,旨在减轻多比柔星诱导的心脏毒性的发生。

《PLoS Biology》:与帕金森病相关的基因突变会导致大脑中的铁错误定位

2022年1月5日获悉,在一项新的研究中,美国国家老龄化研究所的Mark Cookson及其同事们发现一种常见的与帕金森病相关的基因突变驱动铁在活化的小胶质细胞中错误定位。这一结果可能有助于解释这种疾病中受影响的大脑区域中有毒铁的积累,并为开发旨在校正这种铁转运缺陷的疗法提供基础。相关研究结果近期发表在《PLoS Biology》期刊上。论文标题为“Mutations in LRRK2 linked to Parkinson disease sequester Rab8a to damaged lysosomes and regulate transferrin-mediated iron uptake in microglia”。

科学家在靶向性基因疗法开发上取得重大进展

近日,一篇发表在国际杂志《Nature Neuroscience》上题为“AAV capsid variants with brain-wide transgene expression and decreased liver targeting after intravenous delivery in mouse and marmoset”的研究报告中,来自加州理工学院等机构的科学家们通过研究开发了一种基因运输系统,其能特异性地针对脑细胞同时还会避开肝脏,这一点非常重要,因为用于治疗大脑疾病的基因疗法也可能会对肝脏产生毒性免疫反应的副作用,因此科学家们希望找到只针对预定靶点的运输载体,相关研究结果在小鼠和狨猴模型中均得到了证实,而且这也是将该技术转化为人类机体研究的重要一步。

高飞/李铮等揭示男性无精症致病基因,并通过CRISPR基因编辑进行修复

2022年1月4日,中科院动物研究所高飞研究员、上海交通大学附属第一人民医院泌尿外科中心李铮教授等在《Signal Transduction and Targeted Therapy》期刊发表了题为:Oligomer-Targeting Prevention of Neurodegenerative Dementia by Intranasal Rifampicin and Resveratrol Combination – A Preclinical Study in Model Mice的研究论文。该研究揭示了MSH5基因突变是非阻塞性无精症(NOA)潜在致病原因,并在小鼠模型上证实了CRISPR/Cas9基因编辑能够修复该基因突变,产生成熟精子。但并未在附睾尾部发现成熟精子,这可能是由于该系统的基因编辑效率较低所致。还需要进一步研究以提高转染效率和编辑效果。

美国研究人员发现嗅觉受体基因OR5B21与乳腺癌细胞向大脑转移有关

近日,美国麻省总医院的研究人员在《iScience》期刊发表了题为“Olfactory receptor 5B21 drives breast cancer metastasis”的研究论文。该研究发现,嗅觉受体基因OR5B21与乳腺癌细胞向大脑转移有关,抑制该基因可显著降低乳腺癌细胞的转移扩散,为未来预防和治疗乳腺癌带来了新的治疗靶点和希望。 

程强等破解器官选择性mRNA递送系统的机制,扩展mRNA和CRISPR的应用范围

2022年1月4日获悉,来自美国德克萨斯大学西南医学中心Daniel Siegwart教授、程强博士共同在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表了题为“On the mechanism of tissue-specific mRNA delivery by selective organ targeting nanoparticles”的研究论文。该研究进一步解析了选择性器官靶向脂质纳米颗粒能够实现组织特异性递送的具体机制。这将大大扩展mRNA疫苗和药物,以及CRISPR基因编辑疗法的应用范围。 

科学家发现口腔和肠道中特定微生物为了生存能表达让阿卡波糖失活的酶

2022年1月7日获悉,美国普林斯顿大学的Mohamed S. Donia教授及其团队和其他合作单位,在顶级期刊《自然》杂志上发表重要研究成果,论文题目为:“The human microbiome encodes resistance to the antidiabetic drug acarbose”。他们通过宏基因组测序结合生物化学以及结构学等实验分析,发现部分人群的口腔和肠道中天然存在抑制阿卡波糖活性的细菌,它们通过表达阿卡波糖磷酸酶使之失活,减弱了阿卡波糖控制血糖的效果。

科学家开发出新型测序技术,摸清肿瘤细胞位置

2022年1月9日获悉,哈佛大学-麻省理工学院Broad Institute的研究人员开发出了一种具有空间分辨率的DNA测序新技术,名为Slide-DNA-seq。他们还进一步将这种测序技术与高空间分辨率的基因表达分析相结合,以便更好地了解癌症进展,以及开发潜在的治疗方法。研究成果日前登上了顶尖学术期刊《自然》,论文题目为:“Spatial genomics enables multi-modal study of clonal heterogeneity in tissues”。 

《美国医学会杂志网络开放》刊发北京大学刘民教授团队新冠病毒研究成果

近日,北京大学公共卫生学院刘民教授团队在《美国医学会杂志》子刊《美国医学会杂志网络开放》发表了《全球新冠检测人群与确诊患者中无症状感染者比例:一项系统综述与荟萃分析》的论文。通过对95篇论文、涉及新冠感染者3000万人的数据分析,发现新冠感染者中的无症状感染者的比例超过40%。提示新冠防疫的艰难及出现疫情全面核酸筛查的必要性。刘民介绍,无症状感染者是指核酸检测呈阳性,也就是感染了新冠病毒,但没有表现出相应症状的人。更重要的是,无症状感染者同样能够传播新冠给他人,而且由于无症状,他们传播的可能性更大。

新发现!DNA的二级结构或与癌症发生密切相关

近日,一篇发表在国际杂志《Nature Immunology》上题为“TET deficiency perturbs mature B cell homeostasis and promotes oncogenesis associated with accumulation of G-quadruplex and R-loop structures”的研究报告中,来自美国西北大学等机构的科学家们通过研究表示,DNA或会表现为结状褶皱和DNA双链之间的第三层阶梯,从而就可能会驱动癌症发生,而另外一种重要的调节性酶类或与这种不寻常的DNA结构的形成有关。

机体排便习惯写入DNA中,或为开发肠易激综合征的新型疗法提供线索

近日,一篇发表在国际杂志《Cell Genomics》上题为“GWAS of stool frequency provides insights into gastrointestinal motility and irritable bowel syndrome”的研究报告中,来自莫纳什大学等机构的科学家们对超过16万人的DNA信息进行了研究,这些参与者提供了关于其大便频率的相关信息,随后研究人员确定了参与者的基因图谱和特定基因,这些因素会影响其机体的大便习惯以及对IBS的易感性,IBS是最为常见的胃肠道疾病。

一周热闻

癌症基因组学公司Personalis第四季度收入增长超过2%

2022年1月7日,Personalis公布第四季度收入,约为2070万美元,比去年同期的2020万美元增长2%以上。截至12月31日,来自生物制药和其他客户的收入为1540万美元,是其2020年第四季度收入760万美元的两倍多。Personalis估计全年收入约为8550万美元,比2020年的7860万美元增长9%。

投融资

基因细胞治疗药物研发商克睿基因完成6,000万美元B轮融资

2022年1月5日,苏州克睿基因生物科技有限公司宣布完成6000万美元B轮融资。本轮融资由战略投资方尚珹投资(Advantech Capital)领投,元禾控股、蓝海资本、启明创投等机构跟投,华兴资本担任独家财务顾问。本轮融资将主要用于加速克睿基因在血液、实体肿瘤细胞治疗产品的临床开发,推进基于AAV病毒创新血清型筛选及基因编辑产品的开发和国际合作。截至目前,克睿基因累计融资接近1亿美元。

玮美基因完成数千万元天使轮融资,由朗煜资本独家投资

2022年1月7日,上海玮美基因科技有限责任公司近日宣布完成数千万元的天使轮融资。本轮融资由朗煜资本独家投资。融资资金将主要用于基因治疗听力疾病的管线推进;新型AAV载体研发;以及搭建公司核心团队。

纳米孔基因测序仪研发商普译生物完成数千万元天使轮融资

近日,专注于新一代纳米孔基因测序仪产业化的高科技企业—北京普译生物科技有限公司宣布完成数千万元天使轮融资。本轮融资由IDG资本和水木创投联合领投,清华工研院全球健康产业创新中心跟投。本轮融资将主要用于具有自主知识产权的纳米孔蛋白优化,以及基于ASIC芯片的中高通量纳米孔基因测序仪的产品定型。在优质资本加持下,中国有望快速突破新一代基因测序卡脖子环节。 

生物技术公司Ray Therapeutics宣布完成600万美元种子轮融资

2022年1月4日,为致盲性疾病患者开发光遗传基因疗法的生物技术公司Ray Therapeutics宣布完成600万美元种子轮融资,本轮融资由4BIO Capital领投。该公司正在开发其主要候选药物Ray-001,用于治疗色素性视网膜炎,这是一种退行性视网膜疾病,有大量未满足的医疗需求。

DNA合成技术公司DNA Script宣布完成3500万美元C轮融资

2022年1月4日,DNA合成技术公司DNA Script宣布完成3500万美元C轮融资,使C轮融资总额达到2亿美元。本轮融资投资者包括T. Rowe Price Associates、Baillie Gifford、Healthcor Management、eureKARE和Irving Investors。他们加入了Coatue Management、Catalio Capital Management、Fidelity Management & Research Company LLC、Columbia Threadneedle Investments、Casdin Capital以及其他参与第一次融资的投资者。融资的收益将用于推进SYNTAX平台,这是DNA Script公司以其专利EDS技术为动力的第一个商业产品。

基因治疗公司SalioGen Therapeutics完成1.15亿美元B轮融资

2022年1月5日,SalioGen Therapeutics完成1.15亿美元B轮融资,本轮融资由 GordonMD Global Investments和EPIQ Capital Group领投,Fidelity Management & Research Company、T. Rowe Price Associates、D1 Capital Partners、SymBiosis、the Cystic Fibrosis Foundation等跟投,现有投资者PBM Capital追投。SalioGen正在开发基于精确DNA整合技术或EDIT的遗传疾病药物,将利用融资继续开发其治疗平台,扩大员工队伍,并建立制造和自动化能力。

赛默飞世尔科技宣布完成收购生物技术公司PeproTech2

2022年1月5日,赛默飞世尔科技公司和重组蛋白开发商和制造商PeproTech, Inc.宣布于2021年12月30日完成了对PeproTech的收购,现金收购总价约为18.5亿美元。PeproTech公司的重组蛋白产品组合是对赛默飞世尔的细胞培养基产品的补充,并将使赛默飞世尔通过整合的产品为客户提供巨大的利益。通过此次收购,以推动快速增长的细胞和基因疗法市场的发展。

基因疗法公司Kriya Therapeutics宣布收购生物技术公司Warden Bio

2022年1月7日,在基因治疗领域开拓新技术和新疗法的综合性公司Kriya Therapeutics, Inc.宣布收购生物技术公司Warden Bio。根据该协议,Kriya Therapeutics公司获得了Warden Bio公司五个临床前基因治疗项目的独家权利。这次收购为Kriya Therapeutics公司的罕见病部门奠定了基础,该部门专注于发现和开发罕见病的基因疗法。在收购的同时,Warden Bio的联合创始人Kunal Kishnani将加入Kriya,担任其罕见疾病部门的总裁,他将领导整体战略、开发和合作活动。

一周热闻

基因测序行业上市公司业务布局对比

我国基因测序龙头企业的业务辐射范围较广,基本已经形成“覆盖全国、辐射全球”的营销网络。根据业务布局不同,各龙头企业各有其业务侧重。

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2021-2026年中国基因检测行业战略规划和企业战略咨询报告

2021-2026年中国基因修饰行业市场前瞻与投资战略规划分析报告

中国基因检测产业链全景分析报告

2021-2026年中国基因治疗行业市场前瞻与投资战略规划报告

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